Юрий Стародумов

Варианта тут 2:
1) угрожать соседу;
2) обратиться с заявлением в милицию (предварительно не помешает отыскать побольше свидетелей избиения и угроз.
Можно так же уведомить об этом соседе, ибо даже такого уведомления иногда достаточно для успокоения хулиганов).
Хотя я лично понимаю гнев соседа и в чем-то с ним согласен...

нету со стороны следователя и работодателя состава преступления предусмотренного ст. 163 ук рф. Так как угроза разглашения сведений о действительно совершенном преступлении не является обстоятельством существенно нарушающим Ваши законный права и интересы.
Однако, следователя по головке не погладят если узнают, что он умышленно не стал возбуждать УД/либо прекратил его без причины/либо знает где находиться подозреваемый/обвиняемый и ничего не предпринимает полгода, да и "дружба" с работодателем у них какая то "странная". Это наводит лично меня на мысль, что дело спустили на тормозах и Вам уже ничего не грозит, хотя я могу ошибаться.

в милицию по факту хищения обращаться не пробовали?

проникновение в хранилище было законным, так как открыл выполняя трудовые функции по поручению работодателя. Следовательно ч. 1 ст. 158 УК РФ. Будет условный срок максимум (если конечно уже не имеете условный. Думается, что на этот раз Вам повезло, хотя мало ли как там оно...

Какая уж тут задача, в жизни так оно обычно и бывает.
Чтоб на работу не ходить за зря, напишите директору уведомление о том, что Вы приостановили работу в связи с задержкой выплаты з/п (см. ст. 142 ТК РФ). Обязательно заверьте копию этого уведомления у директора (если откажется принять отправляйте телеграммой или заказным письмом с уведомлением). Потом действуйте...
P.S. Если УД в отношении директора все же будет возбуждено отпишитесь в теме очень интересует практика. Желаю удачи!

ООО то ведет какую-нибудь деятельность? Собирается ее вести? Есть ли у ООО имущество?
В рамках гражданского процесса, в данном случае, запрет выезда за границу для РД невозможен.
Если в отношении РД будет возбуждено уголовное дело, то возможно следователь изберет в отношении него меру пресечения, но еще раз повторюсь случаи привлечения РД к уголовной ответственности по 145.1 УК РФ единичны...

Ни директор, ни учредитель по долгам ООО своим имуществом не отвечают поэтому проблемма не в том, что РД сбежит, а в том, что имущество оставшееся может продать и т.п. если иск еще не подан в суд, то подавать надо немедленно(!), если подан уже попытайтесь принять меры по обеспечению иска.
Предварительное следствие по делам о прест. предусм. 145.1 УК РФ производят следователи Следственного Комитета при прокуратуре РФ. Попробуйте обратиться с заявлением, но РД привлекают к уголовной ответственности по этой статье крайне редко...
Параллельно с иском в суд подайте заявление в Прокуратуру и Трудовую инспекцию, иногда очень помогает, в заявлении можете попросить произвести проверку деятельности ООО и рассмотреть вопрос о привличении РД к адм. ответственности по ст. 5.27 КоАП РФ.

Если Вас не пускают на рабочее место необходимо зафиксировать этот факт, иначе есть риск увольнения за прогул.

Ст. 110 УК РФ тут точно не будет, перспективы уголовного преследования медиков в данной ситуации в целом весьма сомнительны, вероятно Вам лучше попробовать добиться возмещения вреда в рамках гражданского дела.

Просто суд признал не существенным нарушение данной нормы, в данном случае.
Т.е. работник действительно совершил прогул, потом заявил работодателю, что не будет давать объяснения, а когда РД не подумавши составил акт после такого заявления, работник решил использовать этот по сути незначительный (так как никаких уважительных причин не было и о чем ему собственно писать в объяснительных?) нюанс в свою пользу. Таким образом просматривается злоупотребление правом со стороны работника, я лично считаю решение справедливым и правосудным.